Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC092112.1-201ENST00000538329 640 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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ITGA9Q13797 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ITGA9Q13797 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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