Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SOS1-201ENST00000395038 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
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SF3B2Q13435 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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SF3B2Q13435 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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SF3B2Q13435 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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SF3B2Q13435 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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SF3B2Q13435 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
SF3B2Q13435 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
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