Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 DRG1-207ENST00000629688 309 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINC02086-202ENST00000492522 2091 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CHN1-204ENST00000409597 1445 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CDON-201ENST00000263577 4186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 S100A1-202ENST00000368696 522 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TBCA-209ENST00000522370 435 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AC068831.6-201ENST00000560522 795 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CLN3Q13286 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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