Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
RBBP4Q09028 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms