Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 TTC26-205ENST00000474035 1193 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PTPRMP28827 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms