Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 CDC7-201ENST00000234626 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ANKRD44-202ENST00000328737 3686 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 OR5AN1-202ENST00000641850 8468 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 BNC1-202ENST00000569704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC011120.1-201ENST00000583916 624 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 OR55B1P-203ENST00000641518 2602 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTPREP23469 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
PTPREP23469 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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