Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC3.46□□□□□ -1.85
PTPRDP23468 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
PTPRDP23468 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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