Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
HOXA3O43365 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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