Protein–RNA interactions for Protein: O14493

CLDN4, Claudin-4, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN4O14493 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CLDN4O14493 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms