Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP35Q9P2H5 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP35Q9P2H5 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP35Q9P2H5 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP35Q9P2H5 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP35Q9P2H5 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP35Q9P2H5 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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USP35Q9P2H5 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
USP35Q9P2H5 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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