Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RMDN2-207ENST00000417700 1426 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SH3BP4Q9P0V3 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms