Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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FOXQ1Q9C009 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
FOXQ1Q9C009 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
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