Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP9-201ENST00000429406 715 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.3 ms