Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 FRMD6-AS2-202ENST00000557625 581 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP6Q3SY56 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms