Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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GRIK4Q16099 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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GRIK4Q16099 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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GRIK4Q16099 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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GRIK4Q16099 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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GRIK4Q16099 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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GRIK4Q16099 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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GRIK4Q16099 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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GRIK4Q16099 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
GRIK4Q16099 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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