Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 NAV2-AS3-201ENST00000534036 598 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
CDH18Q13634 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
CDH18Q13634 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms