Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
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TCOF1Q13428 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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TCOF1Q13428 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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TCOF1Q13428 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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TCOF1Q13428 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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TCOF1Q13428 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TCOF1Q13428 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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