Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP140Q13342 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP140Q13342 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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SP140Q13342 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP140Q13342 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SP140Q13342 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SP140Q13342 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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