Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
NME3Q13232 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms