Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
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TRAF1Q13077 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TRAF1Q13077 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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