Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC011601.1-201ENST00000549710 577 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
BPTFQ12830 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.9 ms