Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CHRNEQ04844 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms