Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD8P13378 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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