Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 PIGK-202ENST00000370812 4596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
CDCA8Q53HL2 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
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