Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AP001048.1-201ENST00000436359 280 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 FAM177B-204ENST00000445590 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC01892-201ENST00000579141 507 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC00663-205ENST00000589508 432 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Q1T7F1 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 GPR33-201ENST00000399285 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RBBP4P5-201ENST00000398583 1266 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
Q1T7F1 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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