Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 PSMA6P1-201ENST00000400275 741 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RPL29P33-201ENST00000587474 316 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC245052.7-201ENST00000601161 359 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CSPP1Q1MSJ5 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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