Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
NRF1Q16656 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms