Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
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