Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
ZNF56Q15929 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ZNF56Q15929 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ZNF56Q15929 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
ZNF56Q15929 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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