Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CUL4AQ13619 HYKK-203ENST00000563233 734 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms