Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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TCIRG1Q13488 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
TCIRG1Q13488 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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