Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TOP3AQ13472 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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