Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXE3Q13461 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXE3Q13461 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXE3Q13461 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXE3Q13461 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXE3Q13461 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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FOXE3Q13461 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXE3Q13461 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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