Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL450344.1-201ENST00000456018 639 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 SH3GLB1-202ENST00000482504 1199 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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TCOF1Q13428 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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TCOF1Q13428 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
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TCOF1Q13428 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
TCOF1Q13428 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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