Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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