Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXF2Q12947 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXF2Q12947 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXF2Q12947 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXF2Q12947 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
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FOXF2Q12947 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
FOXF2Q12947 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
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