Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SREBF2Q12772 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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