Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC068790.7-201ENST00000602347 528 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.5 ms