Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFU1P1-201ENST00000413128 774 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021151.1-201ENST00000506933 183 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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