Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 DMD-211ENST00000378707 7410 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
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LAMA3Q16787 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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LAMA3Q16787 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
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LAMA3Q16787 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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LAMA3Q16787 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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