Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
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