Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FXNQ16595 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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FXNQ16595 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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FXNQ16595 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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FXNQ16595 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
FXNQ16595 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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