Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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SGCAQ16586 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
SGCAQ16586 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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