Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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SYCP1Q15431 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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SYCP1Q15431 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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SYCP1Q15431 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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SYCP1Q15431 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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SYCP1Q15431 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
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