Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CHD4Q14839 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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CHD4Q14839 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHD4Q14839 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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