Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
ATP1A4Q13733 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms