Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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ITGB3BPQ13352 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
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ITGB3BPQ13352 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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ITGB3BPQ13352 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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ITGB3BPQ13352 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AL163642.2-201ENST00000604722 1019 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
ITGB3BPQ13352 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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