Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 OR2BH1P-201ENST00000608850 864 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
NME3Q13232 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
NME3Q13232 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NME3Q13232 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NME3Q13232 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
NME3Q13232 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
NME3Q13232 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms