Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC008728.1-201ENST00000512730 691 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
CHAF1AQ13111 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC008591.1-201ENST00000503616 631 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
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