Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC040162.2-201ENST00000573092 157 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HIPK1-211ENST00000626993 8016 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PARD3-212ENST00000544292 2475 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 GMFG-201ENST00000253054 616 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RN7SL366P-201ENST00000577957 292 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 UFL1-201ENST00000369278 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 APP-206ENST00000359726 3294 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 TIA1-201ENST00000282574 3823 ntTSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 LY75-201ENST00000263636 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL513304.1-201ENST00000432987 359 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RN7SL216P-201ENST00000471607 298 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC007537.1-201ENST00000539347 327 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
MKRN3Q13064 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
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